基金组织的最高权力机构为理事会，由各成员国派正、副理事各一名组成，一般由各国的财政部长或中央银行行长担任。每年9月举行一次会议，各理事会单独行使本国的投票权(各国投票权的大小由其所缴基金份额的多少决定);
执行董事会负责日常工作，行使理事会委托的一切权力，由24名执行董事组成，其中8名由基金份额最大的5个国家(美、日、德、法、英)和另外3个国家(中、俄、沙)任命。
其余16名执行董事由其他成员国分别组成16个选区选举产生;中国为单独选区，亦有一席。
执行董事每两年选举一次;总裁由执行董事会推选，负责基金组织的业务工作，任期5年，可连任，现任总裁是克里斯蒂娜·拉加德，另外还有四名副总裁。
该组织临时委员会被看作是世界两大金融机构之一国际货币基金组织的决策和指导机构。
该委员会将在政策合作与协调，特别是在制订中期战略方面的充分发挥作用。委员会由24名执行董事组成。国际货币基金组织每年与世界银行共同举行年会。
